Jak każdy szanujący się bank, także Bank Gospodarki Żywnościowej umożliwia założenia depozytów. Wśród oferowanych depozytów są lokaty klasyczne na 1,3, 6, 12 i 24 miesiące (również w dolarach i euro), lokaty inwestycyjne i takie, z których stopa zwrotu została oparta o stawkę WIBID.